Les objectifs environnementaux fixés pour une période de trois ans, ainsi que les moyens pour les atteindre, sont décrits dans un document stratégique appelé plan environnemental. Il est ensuite décliné en plans d'actions annuels.

Genève Aéroport suit actuellement le plan environnemental 2011 - 2013, présenté ci-dessous:

• L'intégration de la composante environnementale est renforcée dans les activités et les projets
• Le système de management environnemental fonctionne selon la norme ISO 14001:2004, en synergie avec son système de management intégré
• Les actions environnementales sont communiquées auprès des riverains, des collaborateurs et des partenaires de l'aéroport

• Les classes de bruit des aéronefs sont révisées pour tenir compte de l'évolution prévisible de la technologie 
• L'insonorisation de 600 logements en Suisse au delà du périmètre actuellement considéré (valeurs d'alarme moins 2 dBA) est réalisée
• L'insonorisation de 400 logements sur la commune de Ferney-Voltaire en France voisine est entreprise dans le cadre du dispositif spécifique mis en oeuvre conjointement avec les services techniques de la commune
• Un cadastre du bruit au sol lié à l'exploitation de l'aéroport est élaboré
• Une communication appropriée des mesures prises pour limiter les nuisances occasionnées par l'exploitation de l'aéroport est assurée, en particulier concernant les statistiques et les circonstances exceptionnelles justifiant les dérogations accordées par l'exploitant pour des mouvements d'avion après 0 heure 30

• Les émissions gazeuses liées aux véhicules de service de l'aéroport sont restreintes
• Les émissions gazeuses liées aux avions en stationnement sont réduites
• Le programme d'accréditation carbone des aéroports (ACA) est mis en oeuvre
• Le taux d'utilisation des modes de transports durables par les personnels de l'aéroport est accru
• Le taux d'utilisation des modes de transports durables par les passagers aériens est accru
• L'accessibilité terrestre de l'aéroport par les modes de transport durables est renforcée

• La consommation d'énergie est diminuée de 10%
• Les coûts énergétiques sont optimisés
• L'approvisionnement aux meilleures conditions qualitatives est garanti 

• Le concept d'évacuation des eaux de ruissellement du bassin versant du Vengeron est mis en oeuvre dans le cadre du Plan général d'évacuation des eaux de l'aéroport

• Toute contamination significative des sols est évitée et les pollutions sont cadastrées
• Une nouvelle campagne de surveillance des sols est effectuée

• Le tri des déchets sur le site aéroportuaire est renforcé, suivi et optimisé
• Le principe de pollueur-payeur est généralisé à l'ensemble du site

• La prévention des risques selon l'Ordonnance sur la protection contre les accidents majeurs (OPAM) est optimisée

• La valeur paysagère du site aéroportuaire et ses alentours est préservée
• Le développement des espèces envahissantes est limité